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京都大學醫學研究所基因組醫學中心長崎教授及川口教授

高效能 TS-2483XU-RP 加速並簡化基因組資料分析。

  • 背景

    京都大學醫學研究所基因組醫學研究中心長崎教授及川口教授主要研究基因組、代謝產物、健康資訊，搜尋人類疾病的相關因素。他們針對成千上萬人進行大規模資料分析。

  • 面臨挑戰

    每個人的基因組由 30 億個鹼基對 (3GB) 組成，而在分析基因組時，必須處理大量資料。因此，需要高效能的儲存空間。他們之前採用 RAID 儲存空間來直接連接每台運算伺服器，當作內部部署近線儲存空間來容納所有資料。但這種方法使 I/O 的速度成為瓶頸，因為資料實際上是分散在多個儲存單元中，讓研究人員難以利用。

解決方案

他們安裝了三台 QNAP TS-2483XU-RP，實現高 I/O 效能，並享有過保後的零件易取得性、高成本效益及 NAS 遷移的便利性。TS-2483XU-RP 是一款高效能的 24-bay NAS，採用 Intel ® Xeon® E 處理器，配備最高達 128 GB DDR4 ECC 記憶體，同時提供兩個 10GbE SFP+ 連接埠。他們還安裝了其他高速分散式儲存空間，並與由 QNAP NAS 組成的近線儲存整合，根據資料用途分別儲存資料。分析資料儲存於速度最快的儲存空間中，基礎資料 (較不常用但不可或缺的資料) 則儲存為冷資料。

結果

他們擁有完善的 QNAP 儲存方案，可透過中央管理界面和 GUI設定，大幅降低學習及管理成本。QNAP NAS 易於安裝，是與外部機構交換資料時不可或缺的媒介。他們能夠透過集中化資料存取，增加使用者便利性，建構符合 I/O 要求、具有經濟效益的儲存空間系統。他們正在建構混合式雲端環境，結合三個基礎架構：本地伺服器、公有雲，以及位於 SINET* 學術資訊網路的跨學科高效能運算基礎設施（又稱超級電腦）。不僅僅打造了初期所設想的近線儲存空間，他們還將 QNAP NAS 作為電腦叢集的直接 I/O 環境。未來，這兩位教授的目標是創造更加流暢的環境，集中化每個平台的資料，讓使用者能夠使用所需的資料，而不必在意資料儲存的位置。

* SINET 是日本大學和研究機構的學術 IT 網路基礎設施。

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